Sarah Nexusに関するよくあるご質問

化学物質の遺伝毒性リスクを評価する場合、in silico予測システムの使用は当局申請に不可欠です。EMA、US FDA、ICHなどのガイドラインでは、その重要性が強調されています。最も注目すべきは、ICH M7ガイダンスで、医薬品不純物のDNA 反応性 (変異原性) の可能性を評価するために、2つの補完的な定量的/定性的構造活性相関 ((Q)SAR)システムを適用することが明示的に要求されています。当社の専門家ベースのナレッジツールであるDerek Nexusを補完するため、2013年にSarah Nexusをリリースしました。これは、ICH M7評価を容易にするために設計された統計予測ツールです。Sarah Nexus に関するよくある質問にお答えします。

1. Sarah Nexusとは何ですか?
Sarah Nexusは、弊社が開発した統計ツールです。Sarah Nexusは、統計的に学習された自己組織化仮説ネットワーク (SOHN: Self-Organising Hypothesis Network) から派生したフラグメントベースの構造仮説を使用し、変異原性と染色体損傷を予測します。これらの予測は、細菌の逆変異、染色体異常、および微小核アッセイ データに基づいており、Sarah Nexus は変異原性と遺伝毒性の評価のための堅牢なソリューションとなっています。

2. Sarah Nexusはどのように機能しますか?
Sarah Nexusは、SOHN モデルを使用して、変異原性に関連する構造フラグメントを統計的に分析します。このツールは、大規模なデータセットを活用してパターンを識別し、in vitroでの変異原性と染色体損傷の両方について信頼性の高い予測を生成します。

3. Derek Nexusと Sarah Nexus の違いは何ですか?
Derek Nexus は専門家によるルールベースのシステムであり、Sarah Nexusは統計的アプローチを採用しています。これらを組み合わせることで、両者は補完し合い、ICH M7 ガイドラインの毒性評価要件を満たす完全な ICH M7分類を提供します。

4. Sarah Nexusは ICH M7 への準拠にどのように役立ちますか?
Sarah Nexusは Derek Nexus と連携して、潜在的に変異原性の不純物を予測するための補完的な方法論を備えた 2 つの (Q)SAR モデルを使用するという ICH M7 の要件を満たしています。Sarah Nexus の複数の機能は、不純物の変異原性を評価するための ICH M7 ガイドラインで要求されているように、専門家による予測のレビューをサポートするように設計されています。たとえば、Sarah Nexus には、化合物に対してどの株がテストされたかを示すヒート マップ機能が含まれています。これにより、テストがOECD TG 471で推奨されている 5 つの株または活性を検出する可能性が最も高い株と一致しているかどうかを簡単に確認でき、ICH M7 ガイドラインへの準拠が容易になります。

5. Sarah Nexusはどのようなエンドポイントを予測しますか?
 > 変異原性: 変異原性リスクを評価するために、変異原性の予測と信頼スコアを提供します。
 > 染色体損傷: 染色体異常および小核アッセイのデータに基づいて、すべての染色体異常を含むin vitro染色体損傷を予測します。

6. Sarah Nexusはどのようなデータを使用しますか?
Sarah Nexusは、公開されている情報源からの細菌の逆突然変異データ、in vitro染色体異常、および微小核アッセイ データの大規模なデータセットを使用してトレーニングされています。データセット内の構造は、一貫性と信頼性を確保するために、弊社が開発したプロトコルに従って標準化されています。

7. Sarah Nexusにはトレーニング セットがありますか?
はい、Sarah Nexus は包括的なトレーニングセットへのアクセスを提供します。これは、予測に関連する化学構造を公開し、意思決定プロセスの透明性と洞察を提供します。Sarahモデル構築を使用すると、特定のニーズに合わせてカスタマイズされた Sarahモデルを作成できます。独自のデータを組み込むことで、カスタム モデルを構築し、予測の精度を高め、評価を独自の要件に合わせて調整できます。

8. Sarah Nexusは遺伝毒性不純物の評価をどのようにサポートしますか?
Sarah Nexusで利用できる染色体損傷モデルは、開発プロセスの早い段階で高リスクの候補を特定することでスクリーニングを効率化します。これにより、コストと時間のかかるin vitroまたはin vivo試験への依存が軽減できます。さらに、規制当局が農薬代謝物と不純物のin silico予測をますます重視する中、Sarah Nexus はコンプライアンスとイノベーションのための貴重なツールになります。

9. Sarah Nexusの精度はどのくらいですか?
Sarah Nexusは、独自のデータセットを使用した広範な外部検証を実施しています。この論文では（Regulatory Toxicology and Pharmacology Volume 76, April 2016, Pages 7-20）、バージョン1.1 が、大手製薬会社9 社から提供された非公開データセットに対して評価しました。その結果、特に特異性、対象範囲、バランス精度において、優れたパフォーマンスが明らかになりました。

10. Sarah Nexus で利用できる QMRF はありますか?
はい、Sarah Nexusでは変異原性と染色体損傷の定量モデル報告形式 (QMRF) が利用可能です。これらはソフトウェアヘルプ センターで見つけることができます。変異原性 QMRF はバージョン2.0 から 4.0 まで利用可能で、染色体損傷 QMRF はバージョン 4.0 以降で利用可能です。

11. Sarah Nexus の試用版やデモ版はありますか?
はい、Sarah Nexus およびその他の Lhasa ソリューションについては 2 週間の無料トライアル、またはデモンストレーションをご利用いただけます。
下記までお問い合わせください。

担当：増子　聡
Email: satoshi.mashiko@lhsalimited.org
TEL: 080-9804-1171

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